Pildianalüüs bioteadustes

Toimumise aeg
Maht
1 EAP (26 tundi)
Õppetöö vorm
põimõpe
Toimumiskoht
Tartu
Hind
tasuta
Õppejõud
Miriam Ann Hickey
Kallol Roy
Philip Paškov
A G M Zaman
Õppekava rühm
Tervis ja heaolu, mujal liigitamata
Õppekeel
Inglise
Eesmärk:
Tutvustada automatiseeritud ja poolautomatiseeritud pildianalüüsi bioteadustes. Üliõpilastele tutvustatakse tarkvara, sealhulgas ImageJ, CellProfiler, QuPath, tehisarul põhinevat analüüsi NumPy ja Tensorflow/PyTorch ning looma publitseerimisvalmis pildid, kasutades InkScape
Sihtrühm:
Doktorandid (kõik aastakäigud), magistriõppe üliõpilased, doktorantide juhendajad kõikidest Eesti ülikoolidest.
Kursuse õpiväljundid:
Üliõpilane peab koostama andmekogumi, kasutades programme ImageJ, CellProfiler, QuPath, NumPy and Tensorflow/PyTorch ning looma publitseerimisvalmis joonise, kasutades InkScape
Õppejõud:
Miriam Ann Hickey - PhD
Kallol Roy - PhD
Philip Paškov - loodus- ja täppisteaduste valdkond (LT), täiendusõppija
A G M Zaman - loodus- ja täppisteaduste valdkond (LT), külalisüliõpilane
Content:
Teema Maht Õppejõud
1. Pildianalüüs bioteadustes 2 Miriam Ann Hickey
2. Pildianalüüs bioteadustes 1 Miriam Ann Hickey
3. Pildianalüüs bioteadustes 3 Kallol Roy
4. Pildianalüüs bioteadustes 2 Miriam Ann Hickey
5. Pildianalüüs bioteadustes 2 Miriam Ann Hickey
6. Iseseisev töö 13 Miriam Ann Hickey
7. Pildianalüüs bioteadustes 3 Miriam Ann Hickey

Hinnainfo:
Tasuta
Toimumiskoha info:
Tartu linn Biomeedikum, Ravila 19, 50411 Tartu, aud. 1038
Õppekeskkonna kirjeldus:
1-päevane kursus
Toimumise ajakava ja lisainfo:
Loengud toimuvad ühe päeva jooksul, 08. novembril 2024, algavad kell 9.30 ja lõpevad 17.45.
Nõuded lõpetamiseks:
Home assignment is due within 1 week of the 1-day intensive course. Submission of home assignment within course Moodle page. Students were present for the entire 8 hours of lectures.
Õpiväljundite saavutatuse hindamise viis:
Eristamata (arv, m.arv, mi)
Hindamismeetodid:
Kodutöö
Hindamiskriteeriumid:
Home assignment is due within 1 week of the 1-day intensive course. Submission of home assignment within course Moodle page (Pass-fail). Fail Publication-ready figure not submitted or publication-ready image is of very poor quality (e.g., no legend, very poor format) Pass Publication-ready figure is of sufficient quality (e.g., legend is sufficient for understanding of figure content, statistics are appropriately applied, images are of sufficient quality and are appropriate for the graphs, graphs are appropriately formatted)
Väljastatav dokument:
tunnistus
Täiendav info:
Miriam Ann Hickey, miriam.ann.hickey@ut.ee, +372 +372 737 4361
Programmi kood:
MVBS.TK.020
Täiendusõppe üldinfo:
Elukestva õppe keskus
Ülikooli 18, Tartu, 50090
+372 737 6213

Samas õppevaldkonnas on algamas veel


Toimumise aeg: 07.11.2024 - 22.11.2024 Maht: 2 EAP (52 tundi) Õppetöö vorm: põimõpe Keel: Eesti
#täiendusõpe
Loengud toimuvad Tapa Kultuurikohas (Kesk tn 4) algusega kl 13.
18.09.2024
#täiendusõpe
Loengud toimuvad Rapla Kultuurikeskuse suures saalis algusega kl 13
18.09.2024
#täiendusõpe
Lähiajal algavad koolitused.
06.10.2021
#täiendusõpe
Vaata 22. aprillil üle veebi Tartu Ülikooli väärikate ülikooli 15. tegutsemisaasta konverentsi.
10.04.2024